La línea fundamental de trabajo de FUNDES son los Servicios de Desarrollo Empresarial (SDE), de manera particular la formación empresarial para la PYME, capacitación en gestión para sus colaboradores y consultoría para el mejoramiento de los procesos de negocios y la gestión empresarial.

FUNDES ha diseñado su oferta de SDE, de acuerdo a las necesidades específicas de la etapa que la empresa está enfrentando, ya sea la redefinición de su estrategia, el mejoramiento de sus operaciones, la innovación de sus productos y servicios, el desarrollo de nuevos mercados o la articulación de redes empresariales.